Logo Kabupaten Malinau adalah  “INTIMUNG”, berasal dari gabungan beberapa bahasa setempat, antara lain:

1. INTILUN (bahasa Tidung) yang berarti: bersatu, bergotong royong, bekerja sama.
2. PAMONG (bahasa Lundayeh, Berusu, Abai) yang berarti: bersama-sama/kebersamaan.
3. PEMONG/PEMUNG (asal kata Pemung Taway, bahasa Kenyah) yang berarti: seia-sekata/kebersamaan.

Dari kombinasi beberapa bahasa setempat itulah nama logo kabupaten menjadi “INTIMUNG” yang memiliki makna bersatu dalam kebersamaan, bergotong-royong dalam membangun/bekerja yang dilandasi oleh niat yang tulus dan suci bagi pelaksanaan pembangunan yang jujur dan demokratis.
Arti dan makna/lambang daerah Kabupaten Malinau adalah sebagai berikut:

Lambang Perisai Bersudut Lima:

• Pancasila sebagai dasar dan falsafah Negara Republik Indonesia dan sebagai alat pelindung dalam mencapai cita-cita proklamasi 17 Agustus 1945.

Tulisan Kabupaten Malinau di atas warna hitam diatas warna kuning:

• Dengan penuh kesungguhan, rakyat dan Pemerintah Kabupaten Malinau siap menghadapi masa depan menuju kejayaan.

Bintang berwarna kuning emas:

• Simbol sila pertama dari Pancasila (Tuhan diatas segala-galanya), warna kuning emas mengartikan keluhuran dan keagungan.

Dua Kepala Burung Enggang di atas bunga kapas dan padi:

• Melambangkan keindahan dan keagungan seni budaya dan adat istiadat setempat. Hampir setiap suku di Kabupaten Malinau menganggap Burung Enggang merupakan Raja dan burung yang sangat berwibawa.

Gambar Kapas dan Padi (Simbol Sila Kelima dari Pancasila):

• Melambangkan keadilan dan kemakmuran.Simbol sila pertama dari Pancasila (Tuhan diatas segala-galanya), warna kuning emas mengartikan keluhuran dan keagungan.
• 17 butiran padi melambangkan Proklamasi Kemerdekaan Republik Indonesia.
• 8 buah kapas melambangkan bulan Proklamasi Kemerdekaan Republik Indonesia.
• 4 ikatan di atas dan 5 ikatan di bawah (di bawah kata INTIMUNG) melambangkan arti tahun Kemerdekaan Republik Indonesia.

Gambar Perisai (Telabang) dan Sumpit Bersilang Mandau:

• Merupakan senjata tradisionil khas rakyat Kalimantan Timur umumnya, yang diartikan sebagai sesiapsiagaan rakyat/Pemerintah Kabupaten Malinau menghadapi tantangan masa depan.

12 Untaian Gelombang Kayu dan 10 Untaian Kayu dan 10 Buah Untaian Batubara:

• Merupakan tanggal dan bulan terbentuknya Kabupaten Malinau.

9 tumpukan/muatan kayu dan 9 gundukan/muatan batubara di atas kapal/perahu:

• Merupakan tahun pembentukan Kabupaten Malinau (1999).

Gambar Kapal Warna Kuning:

• Melambangkan pentingnya sarana transportasi perairan untuk melancarkan jantung perekonomian masyarakat Kabupaten Malinau. Warna kuning mengartikan membawa kekayaaan alam Kabupaten Malinau menuju kekayaan dan kemakmuran masyarakat/Pemerintah Kabupaten Malinau.

Point 6,7,8 dan 9 merupakan rangkaian kekayaan adat istiadat dan kekayaan sumber daya alam Kabupaten Malinau yang dilingkari dalam satu kesatuan yang berbentuk jantung yang menjadi andalan utama untuk membangun masyarakat yang adil, makmur dan merata.
Terdapat 3 Gelombang Warna Putih:

• Menggambarkan 3 sungai besar yang terdapat di Kabupaten Malinau, yaitu: Sungai Mentarang, Sungai Tubu dan Sungai Malinau.

Tulisan Intimung pada Pita Warna Putih:

• Berarti berkumpul atau bermusyawarah yang dilandasi oleh niat yang tulus dan suci merupakan kata kunci bagi pelaksanaan pembangunan yang jujur dan demokratis.

Intimung juga mengandung makna: In (indah), Ti (tertib), M (makmur), Ung (unggul).